Четверо братів-черепашок колись потрапили у певну субстанцію, що претворила їх на мутантів та наділила суперсилою. Хлопцям набридло переховуватись від світу людей у каналізації Нью-Йорку і вони вирішили завоювати довіру жителів міста, звершуючи героїчні вчинки.
Пригодницька фантастика «Підлітки-мутанти Черепашки-ніндзя: Погром мутантів» це нова історія про антропоморфних черепах, які борються зі злочинністю Нью-Йорка. Вперше персонажі з’явились на сторінках коміксів у 1984 році. Кевін Істман та Пітер Лерд планували висміювати усі стереотипи тогочасних сюжетів. Шалена популярність героїв змінила їхній задум та вони почали серію коміксів, які виходили до 2014 року. Ідейним натхненником та сценаристом нового фільму став Сет Роген. Для озвучування головних героїв він запросив підлітків. Хлопці записували свої голоси одночасно, разом знаходячись у одному студійному приміщенні, а не по одному без взаємодії між собою, як це відбувається у більшості проектів.